Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ThraP63058 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ThraP63058 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ThraP63058 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ThraP63058 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ThraP63058 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ThraP63058 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ThraP63058 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ThraP63058 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ThraP63058 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ThraP63058 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ThraP63058 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ThraP63058 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ThraP63058 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ThraP63058 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ThraP63058 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ThraP63058 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ThraP63058 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ThraP63058 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ThraP63058 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ThraP63058 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ThraP63058 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ThraP63058 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ThraP63058 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ThraP63058 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ThraP63058 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ThraP63058 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ThraP63058 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ThraP63058 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ThraP63058 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ThraP63058 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ThraP63058 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ThraP63058 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ThraP63058 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ThraP63058 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ThraP63058 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ThraP63058 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ThraP63058 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ThraP63058 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ThraP63058 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ThraP63058 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ThraP63058 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ThraP63058 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ThraP63058 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ThraP63058 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ThraP63058 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ThraP63058 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ThraP63058 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ThraP63058 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ThraP63058 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ThraP63058 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ThraP63058 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ThraP63058 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ThraP63058 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ThraP63058 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ThraP63058 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ThraP63058 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ThraP63058 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ThraP63058 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ThraP63058 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ThraP63058 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ThraP63058 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ThraP63058 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ThraP63058 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ThraP63058 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ThraP63058 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ThraP63058 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ThraP63058 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ThraP63058 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ThraP63058 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ThraP63058 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ThraP63058 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ThraP63058 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ThraP63058 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ThraP63058 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ThraP63058 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ThraP63058 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ThraP63058 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ThraP63058 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ThraP63058 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ThraP63058 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ThraP63058 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ThraP63058 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ThraP63058 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ThraP63058 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ThraP63058 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ThraP63058 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ThraP63058 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ThraP63058 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ThraP63058 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ThraP63058 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ThraP63058 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ThraP63058 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ThraP63058 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ThraP63058 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThraP63058 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThraP63058 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThraP63058 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThraP63058 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ThraP63058 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms