Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps18P62270 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps18P62270 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps18P62270 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps18P62270 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps18P62270 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps18P62270 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps18P62270 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps18P62270 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps18P62270 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps18P62270 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps18P62270 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rps18P62270 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps18P62270 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps18P62270 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps18P62270 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps18P62270 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms