Protein–RNA interactions for Protein: P59900

Emilin3, EMILIN-3, mousemouse

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emilin3P59900 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Emilin3P59900 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Emilin3P59900 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Emilin3P59900 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Emilin3P59900 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Emilin3P59900 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Emilin3P59900 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms