Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rin3P59729 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rin3P59729 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rin3P59729 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rin3P59729 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rin3P59729 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rin3P59729 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rin3P59729 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rin3P59729 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rin3P59729 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rin3P59729 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rin3P59729 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms