Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dpf3P58269 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dpf3P58269 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dpf3P58269 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dpf3P58269 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dpf3P58269 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dpf3P58269 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms