Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tm9sf2P58021 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tm9sf2P58021 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tm9sf2P58021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tm9sf2P58021 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms