Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox7bP56393 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox7bP56393 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox7bP56393 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cox7bP56393 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms