Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Defb1P56386 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defb1P56386 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Defb1P56386 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defb1P56386 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defb1P56386 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defb1P56386 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defb1P56386 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defb1P56386 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Defb1P56386 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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