Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5eP56382 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp5eP56382 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp5eP56382 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5eP56382 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atp5eP56382 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms