Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn5P54830 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn5P54830 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ptpn5P54830 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpn5P54830 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpn5P54830 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpn5P54830 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms