Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fdft1P53798 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fdft1P53798 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fdft1P53798 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fdft1P53798 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fdft1P53798 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fdft1P53798 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fdft1P53798 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fdft1P53798 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fdft1P53798 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms