Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LumP51885 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LumP51885 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LumP51885 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LumP51885 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LumP51885 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LumP51885 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LumP51885 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LumP51885 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LumP51885 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LumP51885 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LumP51885 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LumP51885 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LumP51885 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LumP51885 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LumP51885 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LumP51885 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LumP51885 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LumP51885 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LumP51885 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LumP51885 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LumP51885 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LumP51885 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LumP51885 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LumP51885 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LumP51885 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LumP51885 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LumP51885 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LumP51885 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LumP51885 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LumP51885 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LumP51885 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LumP51885 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LumP51885 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LumP51885 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LumP51885 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LumP51885 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LumP51885 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LumP51885 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LumP51885 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LumP51885 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LumP51885 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LumP51885 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LumP51885 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LumP51885 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LumP51885 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LumP51885 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LumP51885 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LumP51885 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LumP51885 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LumP51885 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LumP51885 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LumP51885 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LumP51885 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LumP51885 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LumP51885 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LumP51885 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LumP51885 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LumP51885 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LumP51885 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LumP51885 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LumP51885 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LumP51885 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LumP51885 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LumP51885 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LumP51885 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LumP51885 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LumP51885 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LumP51885 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LumP51885 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LumP51885 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LumP51885 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LumP51885 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LumP51885 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LumP51885 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LumP51885 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LumP51885 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LumP51885 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LumP51885 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LumP51885 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LumP51885 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LumP51885 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LumP51885 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LumP51885 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LumP51885 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LumP51885 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LumP51885 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LumP51885 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LumP51885 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LumP51885 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LumP51885 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LumP51885 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LumP51885 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LumP51885 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms