Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,34■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17,34■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17,33■□□□□ 0,37
Defa9P50707 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,32■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa9P50707 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17,27■□□□□ 0,36
Defa9P50707 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Defa9P50707 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17,27■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa9P50707 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17,24■□□□□ 0,35
Defa9P50707 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17,24■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa9P50707 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Defa9P50707 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms