Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FmodP50608 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FmodP50608 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FmodP50608 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FmodP50608 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FmodP50608 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FmodP50608 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FmodP50608 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FmodP50608 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FmodP50608 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FmodP50608 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FmodP50608 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FmodP50608 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FmodP50608 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FmodP50608 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FmodP50608 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FmodP50608 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FmodP50608 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FmodP50608 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FmodP50608 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FmodP50608 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FmodP50608 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FmodP50608 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FmodP50608 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FmodP50608 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FmodP50608 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FmodP50608 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FmodP50608 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FmodP50608 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FmodP50608 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FmodP50608 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FmodP50608 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FmodP50608 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FmodP50608 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FmodP50608 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FmodP50608 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FmodP50608 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FmodP50608 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FmodP50608 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FmodP50608 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FmodP50608 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FmodP50608 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FmodP50608 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FmodP50608 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FmodP50608 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FmodP50608 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FmodP50608 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FmodP50608 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FmodP50608 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FmodP50608 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FmodP50608 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FmodP50608 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FmodP50608 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FmodP50608 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FmodP50608 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FmodP50608 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FmodP50608 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FmodP50608 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FmodP50608 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FmodP50608 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FmodP50608 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FmodP50608 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FmodP50608 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FmodP50608 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FmodP50608 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FmodP50608 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FmodP50608 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FmodP50608 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FmodP50608 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FmodP50608 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FmodP50608 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FmodP50608 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FmodP50608 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FmodP50608 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FmodP50608 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FmodP50608 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FmodP50608 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FmodP50608 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FmodP50608 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FmodP50608 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FmodP50608 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FmodP50608 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FmodP50608 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FmodP50608 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FmodP50608 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FmodP50608 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FmodP50608 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FmodP50608 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FmodP50608 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FmodP50608 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FmodP50608 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FmodP50608 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FmodP50608 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FmodP50608 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FmodP50608 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FmodP50608 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FmodP50608 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FmodP50608 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FmodP50608 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FmodP50608 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms