Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SftpbP50405 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SftpbP50405 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SftpbP50405 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SftpbP50405 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SftpbP50405 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SftpbP50405 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpbP50405 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SftpbP50405 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SftpbP50405 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SftpbP50405 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SftpbP50405 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpbP50405 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpbP50405 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpbP50405 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpbP50405 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SftpbP50405 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SftpbP50405 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SftpbP50405 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SftpbP50405 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpbP50405 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SftpbP50405 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms