Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbp3P49194 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbp3P49194 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rbp3P49194 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rbp3P49194 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rbp3P49194 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbp3P49194 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbp3P49194 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms