Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cox8bP48772 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cox8bP48772 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms