Protein–RNA interactions for Protein: P47993

Xcl1, Lymphotactin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xcl1P47993 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xcl1P47993 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xcl1P47993 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xcl1P47993 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xcl1P47993 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms