Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr7P47774 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccr7P47774 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccr7P47774 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccr7P47774 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccr7P47774 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccr7P47774 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr7P47774 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr7P47774 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms