Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgavP43406 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgavP43406 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgavP43406 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ItgavP43406 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgavP43406 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ItgavP43406 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ItgavP43406 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ItgavP43406 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ItgavP43406 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgavP43406 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgavP43406 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgavP43406 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgavP43406 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgavP43406 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgavP43406 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgavP43406 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ItgavP43406 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ItgavP43406 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms