Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf5P43027 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf5P43027 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf5P43027 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf5P43027 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf5P43027 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gdf5P43027 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gdf5P43027 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gdf5P43027 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdf5P43027 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdf5P43027 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf5P43027 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdf5P43027 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms