Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clec3bP43025 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clec3bP43025 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clec3bP43025 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clec3bP43025 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Clec3bP43025 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms