Protein–RNA interactions for Protein: P42866

Oprm1, Mu-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprm1P42866 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Oprm1P42866 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Oprm1P42866 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oprm1P42866 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Oprm1P42866 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Oprm1P42866 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oprm1P42866 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oprm1P42866 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oprm1P42866 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oprm1P42866 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Oprm1P42866 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Oprm1P42866 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Oprm1P42866 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oprm1P42866 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Oprm1P42866 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oprm1P42866 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oprm1P42866 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oprm1P42866 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Oprm1P42866 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Oprm1P42866 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Oprm1P42866 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms