Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ThrbP37242 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ThrbP37242 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThrbP37242 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ThrbP37242 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThrbP37242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ThrbP37242 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ThrbP37242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ThrbP37242 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThrbP37242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ThrbP37242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ThrbP37242 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ThrbP37242 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ThrbP37242 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ThrbP37242 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ThrbP37242 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThrbP37242 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ThrbP37242 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ThrbP37242 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ThrbP37242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms