Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PpargP37238 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PpargP37238 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PpargP37238 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PpargP37238 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PpargP37238 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PpargP37238 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PpargP37238 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PpargP37238 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpargP37238 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpargP37238 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpargP37238 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PpargP37238 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PpargP37238 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpargP37238 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpargP37238 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PpargP37238 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PpargP37238 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PpargP37238 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PpargP37238 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpargP37238 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpargP37238 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PpargP37238 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PpargP37238 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpargP37238 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpargP37238 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpargP37238 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpargP37238 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PpargP37238 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PpargP37238 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpargP37238 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PpargP37238 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PpargP37238 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpargP37238 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpargP37238 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpargP37238 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PpargP37238 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PpargP37238 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpargP37238 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PpargP37238 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpargP37238 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PpargP37238 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpargP37238 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpargP37238 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PpargP37238 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PpargP37238 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PpargP37238 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PpargP37238 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PpargP37238 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PpargP37238 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpargP37238 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PpargP37238 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpargP37238 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpargP37238 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpargP37238 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpargP37238 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpargP37238 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PpargP37238 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpargP37238 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PpargP37238 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpargP37238 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PpargP37238 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpargP37238 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpargP37238 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PpargP37238 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PpargP37238 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PpargP37238 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PpargP37238 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PpargP37238 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PpargP37238 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PpargP37238 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PpargP37238 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpargP37238 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PpargP37238 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpargP37238 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpargP37238 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpargP37238 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpargP37238 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PpargP37238 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpargP37238 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpargP37238 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpargP37238 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpargP37238 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PpargP37238 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PpargP37238 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PpargP37238 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PpargP37238 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PpargP37238 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PpargP37238 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PpargP37238 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PpargP37238 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpargP37238 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpargP37238 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PpargP37238 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms