Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6fP35460 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6fP35460 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6fP35460 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6fP35460 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ly6fP35460 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ly6fP35460 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ly6fP35460 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ly6fP35460 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ly6fP35460 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms