Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Thbs1P35441 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Thbs1P35441 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Thbs1P35441 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Thbs1P35441 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms