Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd22P35329 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd22P35329 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd22P35329 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd22P35329 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd22P35329 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd22P35329 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd22P35329 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd22P35329 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cd22P35329 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cd22P35329 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cd22P35329 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd22P35329 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd22P35329 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd22P35329 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd22P35329 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd22P35329 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd22P35329 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cd22P35329 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cd22P35329 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd22P35329 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd22P35329 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd22P35329 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd22P35329 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd22P35329 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd22P35329 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd22P35329 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd22P35329 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cd22P35329 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd22P35329 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cd22P35329 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cd22P35329 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd22P35329 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd22P35329 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd22P35329 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cd22P35329 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cd22P35329 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd22P35329 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cd22P35329 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd22P35329 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd22P35329 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd22P35329 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd22P35329 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cd22P35329 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms