Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Apoc1P34928 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoc1P34928 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Apoc1P34928 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoc1P34928 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms