Protein–RNA interactions for Protein: P33534

Oprk1, Kappa-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprk1P33534 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Oprk1P33534 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Oprk1P33534 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Oprk1P33534 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Oprk1P33534 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Oprk1P33534 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms