Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PvalbP32848 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PvalbP32848 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PvalbP32848 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PvalbP32848 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PvalbP32848 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PvalbP32848 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PvalbP32848 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PvalbP32848 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PvalbP32848 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PvalbP32848 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PvalbP32848 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PvalbP32848 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PvalbP32848 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms