Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,67
Gjc1P28229 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,42■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Gjc1P28229 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gjc1P28229 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gjc1P28229 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25,2■■□□□ 1,63
Gjc1P28229 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gjc1P28229 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gjc1P28229 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,6 ms