Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pax3P24610 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pax3P24610 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pax3P24610 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pax3P24610 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pax3P24610 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pax3P24610 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pax3P24610 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pax3P24610 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pax3P24610 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pax3P24610 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pax3P24610 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pax3P24610 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pax3P24610 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pax3P24610 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pax3P24610 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pax3P24610 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pax3P24610 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pax3P24610 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pax3P24610 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pax3P24610 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pax3P24610 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pax3P24610 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pax3P24610 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pax3P24610 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pax3P24610 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pax3P24610 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms