Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gria2P23819 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria2P23819 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gria2P23819 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria2P23819 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gria2P23819 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gria2P23819 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria2P23819 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria2P23819 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gria2P23819 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria2P23819 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria2P23819 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria2P23819 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria2P23819 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria2P23819 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria2P23819 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria2P23819 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gria2P23819 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria2P23819 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria2P23819 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria2P23819 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria2P23819 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms