Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata3P23772 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata3P23772 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata3P23772 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata3P23772 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata3P23772 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gata3P23772 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gata3P23772 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata3P23772 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata3P23772 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gata3P23772 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gata3P23772 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms