Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Klra1P20937 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Klra1P20937 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Klra1P20937 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Klra1P20937 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Klra1P20937 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Klra1P20937 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Klra1P20937 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Klra1P20937 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Klra1P20937 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Klra1P20937 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Klra1P20937 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Klra1P20937 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Klra1P20937 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Klra1P20937 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Klra1P20937 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Klra1P20937 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Klra1P20937 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Klra1P20937 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Klra1P20937 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,4 ms