Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a1P19437 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ms4a1P19437 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ms4a1P19437 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ms4a1P19437 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ms4a1P19437 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ms4a1P19437 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms