Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P18530 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18530 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P18530 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P18530 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P18530 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
P18530 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P18530 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
P18530 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
P18530 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18530 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18530 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18530 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18530 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
P18530 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18530 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18530 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18530 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18530 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
P18530 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18530 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18530 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18530 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18530 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
P18530 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P18530 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
P18530 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
P18530 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P18530 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
P18530 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P18530 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
P18530 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
P18530 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P18530 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P18530 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
P18530 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18530 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18530 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18530 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18530 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18530 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
P18530 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18530 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18530 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18530 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
P18530 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P18530 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
P18530 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
P18530 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P18530 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P18530 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P18530 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P18530 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P18530 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P18530 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P18530 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P18530 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P18530 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P18530 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P18530 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P18530 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P18530 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
P18530 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18530 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18530 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18530 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18530 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18530 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P18530 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P18530 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P18530 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P18530 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P18530 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
P18530 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P18530 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P18530 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P18530 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P18530 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P18530 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P18530 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms