Protein–RNA interactions for Protein: P16332

Mut, Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MutP16332 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MutP16332 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MutP16332 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MutP16332 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MutP16332 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MutP16332 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MutP16332 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MutP16332 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MutP16332 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MutP16332 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MutP16332 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MutP16332 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MutP16332 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MutP16332 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MutP16332 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MutP16332 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MutP16332 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MutP16332 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MutP16332 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MutP16332 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MutP16332 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MutP16332 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MutP16332 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MutP16332 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MutP16332 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MutP16332 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MutP16332 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MutP16332 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MutP16332 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MutP16332 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MutP16332 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MutP16332 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MutP16332 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MutP16332 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MutP16332 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MutP16332 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MutP16332 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MutP16332 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MutP16332 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MutP16332 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MutP16332 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MutP16332 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MutP16332 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MutP16332 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MutP16332 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MutP16332 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MutP16332 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MutP16332 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MutP16332 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MutP16332 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MutP16332 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MutP16332 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MutP16332 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MutP16332 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MutP16332 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MutP16332 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MutP16332 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MutP16332 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MutP16332 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MutP16332 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MutP16332 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MutP16332 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MutP16332 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MutP16332 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MutP16332 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MutP16332 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MutP16332 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MutP16332 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MutP16332 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MutP16332 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MutP16332 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MutP16332 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MutP16332 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MutP16332 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MutP16332 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MutP16332 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MutP16332 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MutP16332 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MutP16332 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MutP16332 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MutP16332 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MutP16332 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MutP16332 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MutP16332 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MutP16332 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MutP16332 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MutP16332 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MutP16332 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MutP16332 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MutP16332 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MutP16332 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MutP16332 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MutP16332 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MutP16332 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MutP16332 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MutP16332 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MutP16332 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MutP16332 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MutP16332 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MutP16332 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms