Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F9P16294 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F9P16294 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
F9P16294 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F9P16294 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F9P16294 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F9P16294 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F9P16294 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F9P16294 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
F9P16294 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F9P16294 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F9P16294 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F9P16294 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F9P16294 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
F9P16294 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F9P16294 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F9P16294 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F9P16294 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F9P16294 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
F9P16294 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F9P16294 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
F9P16294 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F9P16294 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F9P16294 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F9P16294 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F9P16294 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F9P16294 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F9P16294 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
F9P16294 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F9P16294 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F9P16294 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F9P16294 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F9P16294 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F9P16294 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F9P16294 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F9P16294 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
F9P16294 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F9P16294 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F9P16294 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
F9P16294 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P16294 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F9P16294 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F9P16294 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
F9P16294 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P16294 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F9P16294 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P16294 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P16294 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P16294 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F9P16294 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P16294 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F9P16294 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P16294 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P16294 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F9P16294 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P16294 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P16294 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
F9P16294 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F9P16294 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P16294 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F9P16294 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F9P16294 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P16294 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P16294 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P16294 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P16294 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P16294 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
F9P16294 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
F9P16294 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
F9P16294 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P16294 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F9P16294 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F9P16294 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P16294 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P16294 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P16294 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P16294 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P16294 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
F9P16294 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P16294 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P16294 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P16294 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P16294 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P16294 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F9P16294 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
F9P16294 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P16294 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P16294 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P16294 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
F9P16294 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F9P16294 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F9P16294 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
F9P16294 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms