Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ntrk2P15209 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ntrk2P15209 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ntrk2P15209 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ntrk2P15209 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ntrk2P15209 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntrk2P15209 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ntrk2P15209 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms