Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H2-Q9P14431 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2-Q9P14431 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q9P14431 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q9P14431 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-Q9P14431 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q9P14431 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q9P14431 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms