Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga5P11688 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga5P11688 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga5P11688 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga5P11688 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga5P11688 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga5P11688 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga5P11688 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga5P11688 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga5P11688 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga5P11688 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga5P11688 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga5P11688 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga5P11688 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga5P11688 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga5P11688 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga5P11688 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms