Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
DmdP11531 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
DmdP11531 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
DmdP11531 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
DmdP11531 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
DmdP11531 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,25■■□□□ 1,47
DmdP11531 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24,25■■□□□ 1,47
DmdP11531 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
DmdP11531 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
DmdP11531 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
DmdP11531 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
DmdP11531 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
DmdP11531 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
DmdP11531 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
DmdP11531 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
DmdP11531 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
DmdP11531 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
DmdP11531 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
DmdP11531 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24,18■■□□□ 1,46
DmdP11531 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
DmdP11531 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
DmdP11531 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
DmdP11531 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
DmdP11531 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24,17■■□□□ 1,46
DmdP11531 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
DmdP11531 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
DmdP11531 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
DmdP11531 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
DmdP11531 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
DmdP11531 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
DmdP11531 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
DmdP11531 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
DmdP11531 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
DmdP11531 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
DmdP11531 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24,12■■□□□ 1,45
DmdP11531 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
DmdP11531 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24,11■■□□□ 1,45
DmdP11531 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24,11■■□□□ 1,45
DmdP11531 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
DmdP11531 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
DmdP11531 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
DmdP11531 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
DmdP11531 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
DmdP11531 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24,09■■□□□ 1,45
DmdP11531 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
DmdP11531 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
DmdP11531 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
DmdP11531 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
DmdP11531 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
DmdP11531 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
DmdP11531 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
DmdP11531 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
DmdP11531 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
DmdP11531 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
DmdP11531 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
DmdP11531 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
DmdP11531 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24,05■■□□□ 1,44
DmdP11531 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
DmdP11531 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24,05■■□□□ 1,44
DmdP11531 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
DmdP11531 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
DmdP11531 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
DmdP11531 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
DmdP11531 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24,04■■□□□ 1,44
DmdP11531 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
DmdP11531 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,03■■□□□ 1,44
DmdP11531 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
DmdP11531 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
DmdP11531 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
DmdP11531 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24,02■■□□□ 1,43
DmdP11531 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
DmdP11531 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
DmdP11531 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
DmdP11531 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
DmdP11531 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
DmdP11531 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
DmdP11531 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
DmdP11531 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
DmdP11531 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
DmdP11531 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23,97■■□□□ 1,43
DmdP11531 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
DmdP11531 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
DmdP11531 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
DmdP11531 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
DmdP11531 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
DmdP11531 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
DmdP11531 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
DmdP11531 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
DmdP11531 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
DmdP11531 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
DmdP11531 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
DmdP11531 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
DmdP11531 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
DmdP11531 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
DmdP11531 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
DmdP11531 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23,91■■□□□ 1,42
DmdP11531 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
DmdP11531 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
DmdP11531 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
DmdP11531 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
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