Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DmdP11531 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DmdP11531 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DmdP11531 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DmdP11531 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DmdP11531 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DmdP11531 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DmdP11531 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DmdP11531 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DmdP11531 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DmdP11531 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DmdP11531 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DmdP11531 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DmdP11531 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DmdP11531 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DmdP11531 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DmdP11531 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DmdP11531 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DmdP11531 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DmdP11531 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DmdP11531 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DmdP11531 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DmdP11531 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DmdP11531 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DmdP11531 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DmdP11531 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DmdP11531 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DmdP11531 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DmdP11531 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DmdP11531 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DmdP11531 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DmdP11531 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DmdP11531 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DmdP11531 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DmdP11531 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DmdP11531 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DmdP11531 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DmdP11531 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DmdP11531 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DmdP11531 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DmdP11531 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DmdP11531 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DmdP11531 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DmdP11531 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DmdP11531 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DmdP11531 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DmdP11531 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DmdP11531 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DmdP11531 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DmdP11531 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DmdP11531 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DmdP11531 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DmdP11531 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DmdP11531 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DmdP11531 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DmdP11531 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DmdP11531 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DmdP11531 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DmdP11531 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DmdP11531 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DmdP11531 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DmdP11531 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DmdP11531 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DmdP11531 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DmdP11531 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DmdP11531 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DmdP11531 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DmdP11531 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DmdP11531 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DmdP11531 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
DmdP11531 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DmdP11531 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DmdP11531 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DmdP11531 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DmdP11531 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DmdP11531 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DmdP11531 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DmdP11531 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DmdP11531 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DmdP11531 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DmdP11531 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DmdP11531 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DmdP11531 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DmdP11531 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DmdP11531 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DmdP11531 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DmdP11531 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DmdP11531 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DmdP11531 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DmdP11531 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DmdP11531 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DmdP11531 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DmdP11531 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DmdP11531 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DmdP11531 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DmdP11531 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DmdP11531 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DmdP11531 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DmdP11531 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DmdP11531 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms