Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb4P10284 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb4P10284 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb4P10284 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb4P10284 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxb4P10284 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxb4P10284 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb4P10284 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 561.9 ms