Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UbbP0CG49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UbbP0CG49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
UbbP0CG49 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UbbP0CG49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UbbP0CG49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms