Protein–RNA interactions for Protein: P0C605

Prkg1, cGMP-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkg1P0C605 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Prkg1P0C605 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prkg1P0C605 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prkg1P0C605 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prkg1P0C605 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prkg1P0C605 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkg1P0C605 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prkg1P0C605 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkg1P0C605 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms