Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprqP0C5E4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprqP0C5E4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprqP0C5E4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PtprqP0C5E4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprqP0C5E4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprqP0C5E4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms