Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csf3P09920 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3P09920 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csf3P09920 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3P09920 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf3P09920 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3P09920 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3P09920 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3P09920 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csf3P09920 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csf3P09920 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3P09920 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csf3P09920 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csf3P09920 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3P09920 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms