Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Itgb1P09055 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb1P09055 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Itgb1P09055 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb1P09055 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb1P09055 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itgb1P09055 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb1P09055 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms